Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms