Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms