Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARHGAP28Q9P2N2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms