Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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