Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPJQ9HC77 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms