Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms