Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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