Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms