Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms