Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms