Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms