Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA9Q9BWV2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms