Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms