Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms