Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FYCO1Q9BQS8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms