Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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SPOCK3Q9BQ16 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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SPOCK3Q9BQ16 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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SPOCK3Q9BQ16 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SPOCK3Q9BQ16 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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