Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP88Q99567 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms