Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms