Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM47Q96LD4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM47Q96LD4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms