Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGLYRP3Q96LB9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms