Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms