Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms