Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC124Q96CT7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms