Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HGDQ93099 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HGDQ93099 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HGDQ93099 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HGDQ93099 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms