Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms