Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB13Q92826 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms