Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms