Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms