Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND24

RNF214, RING finger protein 214, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF214Q8ND24 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms