Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC17Q8N6Y2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms