Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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C9orf40Q8IXQ3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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C9orf40Q8IXQ3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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