Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM48Q8IWZ4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM48Q8IWZ4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM48Q8IWZ4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM48Q8IWZ4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM48Q8IWZ4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM48Q8IWZ4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM48Q8IWZ4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM48Q8IWZ4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms