Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLNKQ7Z7G1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.6 ms