Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG9AQ7Z3C6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms