Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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LINC00299Q6ZSB3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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LINC00299Q6ZSB3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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LINC00299Q6ZSB3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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LINC00299Q6ZSB3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LINC00299Q6ZSB3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LINC00299Q6ZSB3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LINC00299Q6ZSB3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LINC00299Q6ZSB3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LINC00299Q6ZSB3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LINC00299Q6ZSB3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LINC00299Q6ZSB3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LINC00299Q6ZSB3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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