Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC36A4Q6YBV0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms