Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK4Q6UW60 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms