Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms