Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms