Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms