Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms