Protein–RNA interactions for Protein: Q5QJU3

ACER2, Alkaline ceramidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER2Q5QJU3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACER2Q5QJU3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACER2Q5QJU3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms