Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms