Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms