Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL40Q2TBA0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms