Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms