Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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