Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms