Protein–RNA interactions for Protein: Q15714

TSC22D1, TSC22 domain family protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1Q15714 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSC22D1Q15714 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms