Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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SIX1Q15475 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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SIX1Q15475 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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